293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4014 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.28 
 
 
215 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.14 
 
 
221 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
210 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.79 
 
 
233 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.83 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  40.48 
 
 
211 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.51 
 
 
223 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.57 
 
 
201 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  39.04 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.53 
 
 
207 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.62 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 
222 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.2 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.75 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.27 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  36.27 
 
 
201 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.69 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.46 
 
 
217 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.86 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.04 
 
 
201 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.54 
 
 
205 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.42 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.42 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  37.89 
 
 
208 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
208 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
208 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 
199 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 
215 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
199 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
204 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
208 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.92 
 
 
202 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
199 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.85 
 
 
239 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 
215 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.92 
 
 
203 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.19 
 
 
199 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
216 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.9 
 
 
206 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.58 
 
 
191 aa  98.6  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.51 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.6 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.71 
 
 
198 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.6 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.46 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.46 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.48 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.66 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.11 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  35.75 
 
 
201 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 
198 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.94 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.91 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.87 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  34.38 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.55 
 
 
198 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 
204 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.55 
 
 
198 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 
198 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.94 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.43 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  34.9 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.26 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.48 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.61 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  32.82 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.31 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  34.38 
 
 
201 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.16 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.82 
 
 
211 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 
204 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  34.2 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  37.97 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  36.36 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  36.7 
 
 
202 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  34.38 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  35.42 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>