265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0234 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
210 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  52.36 
 
 
221 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.13 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.53 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 
223 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.01 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  36.04 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 
201 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.25 
 
 
218 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.29 
 
 
210 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.27 
 
 
213 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457112  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.19 
 
 
233 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.98 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.93 
 
 
197 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.23 
 
 
207 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
203 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  39.64 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.32 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  37.91 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.28 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.28 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.89 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.54 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.09 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  33.55 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.93 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.93 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.13 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.53 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.41 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  35.56 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.46 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.46 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.95 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.16 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  35 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.43 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  35.59 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.07 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.9 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.22 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.22 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  34.44 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  34.44 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.14 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.9 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.93 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.15 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.32 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
232 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.41 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  33.7 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.52 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  33.89 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  34.66 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  35.56 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.26 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  35.56 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  35.56 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  35.56 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  37.5 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  35.56 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  37.5 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  31.07 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.55 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.46 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  37.5 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  36.96 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.89 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  36.96 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.89 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.62 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  35.5 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.89 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  35.5 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.35 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  32.65 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.03 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.97 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  35.76 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.4 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  33.89 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>