More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2533 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  65.32 
 
 
198 aa  235  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  65.32 
 
 
198 aa  235  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  55.68 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  55.68 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.02 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.02 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  55.14 
 
 
201 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  55.49 
 
 
202 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  55.49 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.13 
 
 
208 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.12 
 
 
206 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.13 
 
 
208 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  56.11 
 
 
206 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  52.41 
 
 
208 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.98 
 
 
202 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.27 
 
 
204 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.49 
 
 
217 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.51 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.22 
 
 
216 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.79 
 
 
202 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.04 
 
 
215 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  51.63 
 
 
203 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  53.51 
 
 
201 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.75 
 
 
232 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.75 
 
 
232 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  51.09 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.58 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  51.09 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  50.54 
 
 
203 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.12 
 
 
206 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  48.69 
 
 
202 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46 
 
 
211 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.76 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  46.15 
 
 
203 aa  178  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
232 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  53.93 
 
 
202 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.41 
 
 
203 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.54 
 
 
182 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.41 
 
 
203 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.48 
 
 
213 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.19 
 
 
212 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.72 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.28 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.34 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.72 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.17 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.26 
 
 
205 aa  171  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.54 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.2 
 
 
197 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
209 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.56 
 
 
199 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  45.5 
 
 
199 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.56 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 
199 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 
204 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
201 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.7 
 
 
209 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 
199 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  43.72 
 
 
201 aa  150  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40 
 
 
202 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  43.22 
 
 
201 aa  148  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  43.22 
 
 
201 aa  148  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  43.22 
 
 
201 aa  148  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.22 
 
 
201 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  43.22 
 
 
201 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 
201 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  43.08 
 
 
201 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  43.08 
 
 
201 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 
207 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.8 
 
 
213 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  43.89 
 
 
201 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  43.89 
 
 
201 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  43.89 
 
 
201 aa  147  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  42.71 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.27 
 
 
213 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  42.78 
 
 
201 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  45.4 
 
 
194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  44.83 
 
 
213 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  42.78 
 
 
201 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  42.78 
 
 
201 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  42.78 
 
 
201 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  42.78 
 
 
201 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  41.8 
 
 
201 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.13 
 
 
198 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  42.71 
 
 
201 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.13 
 
 
198 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.54 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  40.91 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  42.46 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  41.45 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.53 
 
 
199 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.46 
 
 
204 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.46 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
198 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  39.59 
 
 
197 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40 
 
 
198 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>