297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1651 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  60.28 
 
 
218 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.63 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 
210 aa  144  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.25 
 
 
233 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.28 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.39 
 
 
223 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  36.63 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 
207 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.72 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.45 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  39.41 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.19 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.69 
 
 
199 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.19 
 
 
213 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.06 
 
 
217 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 
199 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 
199 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
208 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
208 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
216 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.1 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.1 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.7 
 
 
216 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.18 
 
 
216 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.17 
 
 
213 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  37.04 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.32 
 
 
201 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36.46 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.68 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.32 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  37.85 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.32 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.46 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  30.73 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  36.08 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  35.42 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.03 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  35.42 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  35.42 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.38 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.5 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.45 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  32.63 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  35.59 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
202 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  34.38 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  34.38 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.11 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  35.03 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.33 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  35.03 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.38 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  34.38 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.82 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
202 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.67 
 
 
191 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.66 
 
 
198 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.92 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.92 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  34.46 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.32 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.43 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  34.46 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.82 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.82 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.82 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  33.78 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.94 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.52 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.66 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  33.85 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>