277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5035 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.13 
 
 
221 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.44 
 
 
201 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.6 
 
 
218 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.29 
 
 
210 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.25 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.18 
 
 
223 aa  141  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  41.31 
 
 
211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.59 
 
 
207 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  36.86 
 
 
221 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
207 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.71 
 
 
210 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  32.73 
 
 
210 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 
222 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.2 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  38.42 
 
 
208 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.48 
 
 
199 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
199 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.12 
 
 
215 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.48 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.59 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35 
 
 
204 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.8 
 
 
199 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.22 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  34.62 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.69 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  36.25 
 
 
202 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.53 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.98 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.54 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.11 
 
 
206 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.69 
 
 
203 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.95 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.2 
 
 
217 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.85 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.05 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.05 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.03 
 
 
216 aa  89  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.48 
 
 
211 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.03 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  30.53 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.55 
 
 
198 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 
205 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.55 
 
 
198 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.99 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.21 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.21 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.08 
 
 
194 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
207 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  31.22 
 
 
203 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  34.92 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
198 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.11 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.14 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  33.86 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.92 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.95 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.16 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  32.89 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.61 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  33.86 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.21 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  33.68 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.21 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  33.68 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.09 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  33.68 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  33.68 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  33.68 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  33.63 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.27 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.35 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  31.61 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.74 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.94 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  32.07 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  31.44 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  31.44 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  31.44 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  30.22 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.44 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  32.64 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  32.07 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  28.76 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  31.52 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>