282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5333 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  100 
 
 
221 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.89 
 
 
210 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.7 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.28 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  39.47 
 
 
211 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.04 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.54 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.8 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.93 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.32 
 
 
213 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 
207 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.79 
 
 
199 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.36 
 
 
198 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  41.33 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.72 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.88 
 
 
199 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.93 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.55 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.72 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.27 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.27 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.92 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.55 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.9 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.29 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.55 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  41.22 
 
 
206 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.76 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.74 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.54 
 
 
215 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 
195 aa  92  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  38.89 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.67 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.67 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.39 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.39 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.35 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
199 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.79 
 
 
207 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.88 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.26 
 
 
182 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.35 
 
 
203 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.37 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.9 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
199 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.26 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.76 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.26 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  33.54 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.71 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.71 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.35 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.91 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.46 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.93 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.71 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.71 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.71 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.71 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.93 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.71 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.76 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.06 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.91 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  35.81 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.31 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.76 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.74 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  34.01 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.6 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  35.21 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.73 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.33 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.05 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  34.01 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  37.24 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.7 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.56 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  36.69 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2463  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.73 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  34.69 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>