287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3273 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.13 
 
 
206 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.38 
 
 
208 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.38 
 
 
208 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.9 
 
 
208 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4351  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.75 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 
206 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129409  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.13 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.2 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  39.38 
 
 
199 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.98 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  42.25 
 
 
208 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
208 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
208 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0023  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
211 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00721211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.98 
 
 
204 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.24 
 
 
199 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.13 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.62 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  38.61 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4073  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.57 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  44.02 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.1 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.01 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  38.61 
 
 
213 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  37.57 
 
 
201 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  36.14 
 
 
201 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  37.57 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  37.57 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  37.57 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  41.94 
 
 
202 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  37.04 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.91 
 
 
202 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
221 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.71 
 
 
214 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.71 
 
 
214 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.56 
 
 
199 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  38.8 
 
 
203 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  37.5 
 
 
201 aa  121  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.68 
 
 
198 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  35.98 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  35.98 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  35.98 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.5 
 
 
232 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
198 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.26 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  37.5 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.34 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.76 
 
 
206 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.43 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.43 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.97 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.59 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.59 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.13 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.59 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.75 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.59 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  37.04 
 
 
201 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.12 
 
 
202 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.7 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  35.32 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  38.25 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36.46 
 
 
201 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 
202 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  35.94 
 
 
201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.78 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.64 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.02 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.02 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.2 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.59 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.56 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.56 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.46 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.36 
 
 
217 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.97 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 
207 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  38.8 
 
 
203 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  36.79 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.68 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  37.7 
 
 
203 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  36.6 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>