294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0699 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.1 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.09 
 
 
210 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.62 
 
 
210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.62 
 
 
210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  36.79 
 
 
210 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  38.42 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.8 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.19 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  35.68 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  36.15 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.96 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  34.29 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  35.21 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  34.29 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  35.21 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  34.29 
 
 
208 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  35.71 
 
 
230 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  35.71 
 
 
230 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  33.33 
 
 
208 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  35.24 
 
 
230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  35.24 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  35.24 
 
 
230 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  35.24 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  35.24 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  35.24 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
210 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  32.86 
 
 
208 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
208 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  36.19 
 
 
208 aa  121  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
208 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  34.29 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.46 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.71 
 
 
232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.41 
 
 
201 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  33.33 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  36.87 
 
 
201 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  37.37 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  37.37 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  37.37 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  35.92 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  35.21 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  35.35 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.35 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  35.35 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  37 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  35.35 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  37 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  37 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  37 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.82 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  37 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  35.12 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  37 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  37 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  35.35 
 
 
201 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.23 
 
 
201 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  35.35 
 
 
201 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  32.7 
 
 
198 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  36.67 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.35 
 
 
201 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  35.35 
 
 
201 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  37 
 
 
198 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.7 
 
 
198 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.19 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.83 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  34.85 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.79 
 
 
198 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.83 
 
 
213 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.96 
 
 
203 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  34.63 
 
 
201 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  35.35 
 
 
197 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  37.17 
 
 
201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  37.17 
 
 
201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.79 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.79 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.79 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  37.17 
 
 
201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  37.17 
 
 
201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  37.17 
 
 
201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
198 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>