278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0135 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 229 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  97.82 
 
 		 229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  59.42 
 
 		 219 aa  268  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.64 
 
 		 227 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.92 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.85 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.66 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.93 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.36 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.36 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.73 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.64 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.67 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.87 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.98 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.49 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.35 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.62 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.48 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.13 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.05 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.83 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.89 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.46 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  32.46 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.21 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.46 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  32.46 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  32.46 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  32.46 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  32.46 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  32.46 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.53 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  33.85 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  33.85 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  33.85 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.89 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  31.89 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  31.94 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.14 
 
 		 198 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.55 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.55 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  30.19 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  34.2 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  33.49 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  34.2 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.64 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  95.9  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  32.82 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.26 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.72 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  31.6 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  31.61 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  31.58 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  33.16 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  33.51 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  31.12 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.35 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.96 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.91 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  33.11 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.41 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  34.27 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.5 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  33.71 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  35.15 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  31.28 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  36.18 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  32.11 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  33.71 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>