More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  90.05 
 
 		 212 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  78.2 
 
 		 212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.32 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.51 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  41.63 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.58 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.44 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.29 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.73 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.42 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.1 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 		 199 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.45 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.68 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.45 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.42 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.94 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.35 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.5 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.69 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.52 
 
 		 194 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  39.05 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.2 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.22 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  37.26 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  37.74 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.5 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.5 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.1 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  40.19 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.5 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  37.5 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  37.5 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.5 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  37.5 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  37.5 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.54 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  39.89 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.54 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  40.29 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.02 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.02 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  40.29 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.37 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  40.29 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  37.7 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.37 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.42 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  40.29 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  37.97 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  37.38 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  37.7 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  37.38 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  37.38 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  37.97 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  37.97 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  37.7 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.7 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  37.7 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  39.81 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.84 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  35.12 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  34.95 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  36.89 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.14 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.61 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  36.95 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  37.85 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.47 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  37.62 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.63 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.54 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  36.59 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  34.59 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  36.13 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  37.14 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  37.14 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  37.14 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.63 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>