More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2904 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  75.68 
 
 
195 aa  277  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  40.32 
 
 
188 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  41.3 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  44.86 
 
 
184 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.76 
 
 
189 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.01 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  42.7 
 
 
192 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.8 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  41.36 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.02 
 
 
190 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  38.3 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  41.49 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.49 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  42.55 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  42.55 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  42.55 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  42.55 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  42.55 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.86 
 
 
189 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  42.55 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  42.55 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.4 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  42.55 
 
 
264 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  38.3 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  37.77 
 
 
190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  42.02 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  42.39 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.89 
 
 
190 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  41.57 
 
 
190 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  39.89 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
213 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.44 
 
 
205 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.23 
 
 
184 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  41.4 
 
 
191 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  41.62 
 
 
193 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.25 
 
 
206 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  40.82 
 
 
218 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.71 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.49 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.11 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  38.3 
 
 
190 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  36.67 
 
 
200 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  39.25 
 
 
203 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.43 
 
 
201 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.57 
 
 
184 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.63 
 
 
184 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.77 
 
 
190 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  40 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  38.66 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.99 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  41.92 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.17 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.39 
 
 
184 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.17 
 
 
184 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.97 
 
 
211 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.33 
 
 
196 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.33 
 
 
196 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.22 
 
 
196 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  37.85 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  37.08 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  38.85 
 
 
159 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  33.33 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  32.66 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  31.58 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  35.26 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  28.91 
 
 
200 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  28.91 
 
 
200 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  36.69 
 
 
135 aa  85.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.3 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  31.9 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  30.66 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  30.54 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  26.98 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  30.25 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  34.87 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.11 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  30.86 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  32.64 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  30.25 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.25 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  30.25 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  32.3 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  30.3 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  40.98 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  34.29 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  30.3 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  29.47 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  30.25 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  30.88 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  32.08 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.86 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.16 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  28.72 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  34.27 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>