261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4981 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  67.93 
 
 		 184 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.08 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  69.78 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  65.22 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  65.57 
 
 		 183 aa  257  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.68 
 
 		 184 aa  254  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  65.75 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.19 
 
 		 184 aa  239  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  59.89 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.44 
 
 		 183 aa  233  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.74 
 
 		 184 aa  231  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.67 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.89 
 
 		 190 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.89 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.34 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.36 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.45 
 
 		 190 aa  221  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.69 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 196 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  58.2 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.22 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.75 
 
 		 190 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.75 
 
 		 190 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  57.75 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.66 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  61.33 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  61.33 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  57.22 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  57.22 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  57.22 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  57.22 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  57.22 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.79 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  57.22 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  57.22 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  56.08 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  57.22 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.68 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  56.84 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.32 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  54.74 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  55.08 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.48 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  52.2 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  45.11 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  45.56 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  48.15 
 
 		 189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.09 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  47.87 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.09 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.87 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.26 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.52 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  41.8 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  41.58 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  37.43 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.43 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  45.71 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  36.84 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  41.8 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  33.84 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  41.3 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  39.01 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.74 
 
 		 160 aa  85.5  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.72 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.19 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  26.73 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.85 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.23 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  28.5 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  27.67 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.82 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.67 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  44.9 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  44.9 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  26.24 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  24.5 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  26.24 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  44.9 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  26.24 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  28.24 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  26.24 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  28.78 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  27.4 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.06 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  25.74 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  29.61 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  27.94 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  32.62 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>