286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2449 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  69.47 
 
 
191 aa  272  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  62.2 
 
 
237 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  63.21 
 
 
264 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  63.83 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  63.83 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  63.83 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  63.83 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  63.83 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.7 
 
 
190 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  63.3 
 
 
191 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  63.3 
 
 
191 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.7 
 
 
190 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.7 
 
 
190 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.7 
 
 
190 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.73 
 
 
190 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.21 
 
 
190 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  58.73 
 
 
184 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  56.61 
 
 
184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.38 
 
 
191 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  55.44 
 
 
184 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.26 
 
 
183 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.08 
 
 
185 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  54.59 
 
 
190 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.61 
 
 
184 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  54.59 
 
 
190 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.59 
 
 
190 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.51 
 
 
204 aa  204  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  56.38 
 
 
190 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  53.51 
 
 
183 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 
184 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 
184 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.63 
 
 
184 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.85 
 
 
190 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.04 
 
 
190 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.97 
 
 
184 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  51.32 
 
 
184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.21 
 
 
184 aa  195  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.14 
 
 
184 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  53.4 
 
 
184 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  51.34 
 
 
193 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.26 
 
 
211 aa  185  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.34 
 
 
196 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.34 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.34 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  48.73 
 
 
196 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  48.22 
 
 
196 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  51.34 
 
 
213 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  47.37 
 
 
188 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
192 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.28 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.24 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  45.21 
 
 
189 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  43.68 
 
 
190 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  46.81 
 
 
203 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.32 
 
 
201 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  45.6 
 
 
189 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.19 
 
 
189 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.85 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  35.78 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  44.5 
 
 
205 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  47.76 
 
 
159 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
213 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  40.82 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.18 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  34.56 
 
 
194 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  42.19 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  38.97 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  39.25 
 
 
178 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  39.18 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  41.3 
 
 
135 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  34.13 
 
 
204 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  32.06 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  31.31 
 
 
204 aa  89  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  31.71 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.35 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.22 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  28.29 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  29.61 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  28.29 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.88 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  27.8 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  30.73 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  27.8 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  32.68 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  30.24 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  31.22 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.95 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  30.39 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  28.64 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  28.16 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  30.24 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  27.45 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.55 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  31.22 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.76 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>