More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4867 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 
192 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  59.89 
 
 
188 aa  221  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  59.36 
 
 
189 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.11 
 
 
189 aa  194  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  51.35 
 
 
189 aa  194  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  53.4 
 
 
213 aa  193  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  65.75 
 
 
159 aa  191  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.27 
 
 
189 aa  188  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  52.41 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  50.8 
 
 
190 aa  177  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  48.44 
 
 
190 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  49.48 
 
 
264 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  48.97 
 
 
237 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.7 
 
 
190 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.7 
 
 
190 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  49.48 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  49.48 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  49.48 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  49.48 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  49.48 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  48.69 
 
 
191 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  48.96 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  48.96 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  47.92 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.92 
 
 
190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  48.24 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.67 
 
 
190 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.96 
 
 
201 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.4 
 
 
190 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.43 
 
 
191 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.67 
 
 
190 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.67 
 
 
190 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.73 
 
 
184 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.12 
 
 
184 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.49 
 
 
190 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  46.35 
 
 
184 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.07 
 
 
184 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.37 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.15 
 
 
196 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  48.72 
 
 
190 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.39 
 
 
196 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.39 
 
 
196 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.6 
 
 
184 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.44 
 
 
190 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  46.81 
 
 
184 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  45.73 
 
 
196 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  46.32 
 
 
184 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.33 
 
 
211 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  46.63 
 
 
184 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.03 
 
 
183 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  46.19 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  51.3 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.26 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.23 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  43.09 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 
213 aa  135  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  43.75 
 
 
195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  43.3 
 
 
189 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  41.21 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 
205 aa  131  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  43.68 
 
 
184 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  56.6 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  41.62 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  56.6 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  56.6 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.07 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.19 
 
 
184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  42.78 
 
 
193 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.55 
 
 
184 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  54.29 
 
 
109 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  53.33 
 
 
109 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  39.04 
 
 
178 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  37.56 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  44.76 
 
 
135 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  31.75 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  31.4 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  29.95 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.69 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.24 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  32.54 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  31.28 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  29.38 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  32.85 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  33.18 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  29.19 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  29.19 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  31.22 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  31.1 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  31.28 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  30.73 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  31.28 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  30.62 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  29.44 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.33 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  30.2 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  28.97 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.52 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  29.72 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>