285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0416 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  98.41 
 
 
189 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  65.05 
 
 
190 aa  254  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.59 
 
 
184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  57.3 
 
 
192 aa  216  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  52.97 
 
 
188 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.8 
 
 
189 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.27 
 
 
206 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  51.61 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.89 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.89 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.81 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  53.51 
 
 
189 aa  177  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  49.73 
 
 
191 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  50 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.27 
 
 
190 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  49.19 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.73 
 
 
190 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.73 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  48.66 
 
 
203 aa  171  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.4 
 
 
191 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  46.28 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  57.55 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  49.19 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.2 
 
 
190 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  45.41 
 
 
190 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.62 
 
 
184 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  44.86 
 
 
190 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.32 
 
 
190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 
201 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 
205 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  43.85 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  43.62 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  52.75 
 
 
205 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  46.32 
 
 
184 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.87 
 
 
190 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  42.7 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  43.01 
 
 
183 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.87 
 
 
185 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 
184 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.06 
 
 
211 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  43.92 
 
 
184 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.51 
 
 
196 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  43.62 
 
 
184 aa  141  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  47.06 
 
 
196 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  45.99 
 
 
196 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  40.21 
 
 
184 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.25 
 
 
184 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.96 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.96 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  40.76 
 
 
186 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  40 
 
 
178 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.8 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  40.76 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.86 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.22 
 
 
183 aa  131  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  44.5 
 
 
193 aa  130  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 
204 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.4 
 
 
184 aa  124  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 
187 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  41.99 
 
 
184 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  36.08 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  56.07 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  56.07 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  56.07 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.22 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  37.88 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  43.26 
 
 
135 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  56.31 
 
 
109 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  54.37 
 
 
109 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.11 
 
 
160 aa  88.6  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  30.58 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  28.64 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  27.49 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.26 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.58 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.43 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  35.71 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  29.11 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.7 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.07 
 
 
202 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  29.67 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  28.08 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  31.65 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  30.73 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.57 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  31.68 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  32.14 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  25.12 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.57 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  28.5 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  30.81 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  32.14 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>