291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0234 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 190 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  98.42 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  96.84 
 
 		 190 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.16 
 
 		 190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.16 
 
 		 190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  90.96 
 
 		 190 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  86.17 
 
 		 237 aa  337  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  85.11 
 
 		 264 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  85.11 
 
 		 191 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  85.11 
 
 		 191 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  85.11 
 
 		 191 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  85.11 
 
 		 191 aa  331  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  85.11 
 
 		 191 aa  331  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  84.57 
 
 		 191 aa  329  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  84.57 
 
 		 191 aa  329  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  79.26 
 
 		 191 aa  315  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  78.42 
 
 		 190 aa  297  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  78.95 
 
 		 190 aa  294  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  68.95 
 
 		 190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  68.09 
 
 		 190 aa  270  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.09 
 
 		 190 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  65.22 
 
 		 184 aa  239  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  61.7 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  63.74 
 
 		 191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  61.54 
 
 		 183 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  58.42 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.36 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.43 
 
 		 204 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  57.61 
 
 		 184 aa  220  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  59.67 
 
 		 184 aa  217  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.24 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.66 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.69 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  56.76 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.75 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.79 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 		 184 aa  201  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.68 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.08 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.74 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.38 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  51.58 
 
 		 213 aa  191  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.38 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.38 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  50.81 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.63 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  53.48 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  52.11 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  53.48 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.27 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  49.2 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  49.44 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.75 
 
 		 201 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.7 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  48.66 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.74 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  48.15 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  42.39 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  43.96 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.02 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  48.25 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  43.01 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  44.81 
 
 		 178 aa  127  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  43.33 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  40.21 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  37.88 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  49.24 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  38.42 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.75 
 
 		 160 aa  87.8  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  32.65 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  32.87 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.17 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  32.99 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  35 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31.12 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  32.14 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31.12 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  32.14 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  29.81 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  31.63 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  36.88 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  45.71 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  45.71 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  45.71 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  30.2 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  30.46 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  34 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.24 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  32.52 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.06 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  31.4 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  29.27 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  44.23 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>