233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4063 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  97.96 
 
 		 196 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  83.51 
 
 		 196 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  83.51 
 
 		 196 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  82.47 
 
 		 196 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.63 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.94 
 
 		 211 aa  276  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  62.98 
 
 		 184 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.09 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.78 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  63.43 
 
 		 183 aa  237  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.22 
 
 		 184 aa  237  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  61.88 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  60.99 
 
 		 184 aa  235  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  65 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  60.99 
 
 		 184 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.33 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  64.04 
 
 		 193 aa  227  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.22 
 
 		 204 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.43 
 
 		 184 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.7 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.39 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.56 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  57.14 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.16 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  54.74 
 
 		 191 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  54.74 
 
 		 191 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  54.74 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  55.61 
 
 		 237 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  54.74 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  54.74 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  54.74 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  54.74 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  54.74 
 
 		 264 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.55 
 
 		 190 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.97 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.59 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.48 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.59 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  52.91 
 
 		 191 aa  194  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  52.63 
 
 		 190 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  52.66 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.66 
 
 		 190 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  55.85 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  48.73 
 
 		 218 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.03 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.22 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  47.34 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.59 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  47.06 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  45.26 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  48.66 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  45.6 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  47.51 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.24 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.37 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  48.95 
 
 		 159 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  46.15 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  36.76 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.78 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  35 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  42.03 
 
 		 135 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.74 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  40.78 
 
 		 178 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  32.81 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.4 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  30.92 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.89 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.04 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  28.08 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  33.8 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  32.37 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  27.96 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  31.28 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  39.45 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.76 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.76 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.56 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  28.99 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.72 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  35.34 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  33.82 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  29.15 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  28.85 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  28.64 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  30.2 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  37.61 
 
 		 109 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  29.8 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  26.73 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>