20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0351 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 
142 aa  289  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  36.46 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  32.08 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  35.96 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  32.18 
 
 
176 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  27.27 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  27.27 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  31.07 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  31.03 
 
 
178 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.85 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  26.89 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  30.16 
 
 
175 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  31.52 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  27.84 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  26.05 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  34.15 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  25.66 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  25.23 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>