32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0903 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  322  9e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  42.48 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  26.27 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  31.07 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  35.4 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  30.23 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  34.51 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  27.81 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  31.25 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  33.63 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  27.93 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.91 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  28.95 
 
 
175 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
164 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  29.75 
 
 
159 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.12 
 
 
272 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  34.21 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  34.07 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  26.53 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  28.26 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  36.59 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  28.7 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  27.83 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  31.52 
 
 
196 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 
189 aa  43.9  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  38.2 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  27.45 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>