60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1855 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  64.5 
 
 		 170 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  49.09 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  42.86 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  38.73 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  41.25 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  41.18 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  41.91 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  41.91 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  33.61 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  28 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  25.32 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.02 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  26.83 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  25.18 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  25.31 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  28.03 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  24.07 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  24.68 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  24.68 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  26.32 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  25.6 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  32.08 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.94 
 
 		 489 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  31.4 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.63 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  24.39 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  24.24 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  24.8 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  33.7 
 
 		 106 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  28.3 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  27.87 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  25.76 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25.26 
 
 		 141 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  25 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  24.39 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  23.14 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  21.43 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  29.17 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  28.74 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  26.98 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  24.85 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  30.3 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  30.66 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  26.24 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  25.89 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 428 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  25.38 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.9 
 
 		 158 aa  41.2  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>