39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1745 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  325  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  91.19 
 
 
173 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  86.16 
 
 
173 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  43.26 
 
 
170 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  41.13 
 
 
178 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  41.91 
 
 
191 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  42.45 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  42.68 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  41.3 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  40.96 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  25.2 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  32.09 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  26.86 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  31.58 
 
 
162 aa  61.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  27.42 
 
 
161 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  28.78 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  29 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  26.87 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  28.45 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 
196 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  28.26 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  32.14 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  29.17 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.12 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  27.48 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  27.59 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  22.48 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  33.64 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  32.32 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  28.12 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  23.75 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  24.43 
 
 
230 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  26.17 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
188 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>