17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0173 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2367  hypothetical protein  38.43 
 
 
316 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2119  hypothetical protein  36.08 
 
 
315 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3975  hypothetical protein  34.29 
 
 
329 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3390  hypothetical protein  38.1 
 
 
310 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6851  hypothetical protein  32.09 
 
 
306 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258194  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0391  hypothetical protein  36.36 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106466  normal  0.105659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5796  hypothetical protein  36.81 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1103  hypothetical protein  29.63 
 
 
300 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0548  dialkylrecorsinol condensing enzyme DarA  35.61 
 
 
296 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.339602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  29.61 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  26.47 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4073  hypothetical protein  25.63 
 
 
463 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.446677  decreased coverage  0.00970707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  35.51 
 
 
173 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  27.05 
 
 
186 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  25.45 
 
 
160 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  26.67 
 
 
196 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>