13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3975 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3975  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3390  hypothetical protein  60.84 
 
 		 310 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2367  hypothetical protein  50.64 
 
 		 316 aa  332  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2119  hypothetical protein  46.01 
 
 		 315 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6851  hypothetical protein  39.27 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258194  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1103  hypothetical protein  33.91 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0548  dialkylrecorsinol condensing enzyme DarA  37.09 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.339602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5796  hypothetical protein  33.66 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  34.29 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0391  hypothetical protein  34.02 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106466  normal  0.105659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  26.36 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  26.52 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4073  hypothetical protein  22.54 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.446677  decreased coverage  0.00970707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>