39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3384 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  63.51 
 
 
228 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1103  hypothetical protein  25.12 
 
 
300 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0548  dialkylrecorsinol condensing enzyme DarA  28.37 
 
 
296 aa  82  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.339602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  29.61 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2367  hypothetical protein  25.47 
 
 
316 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2119  hypothetical protein  28.16 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3390  hypothetical protein  27.1 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3975  hypothetical protein  26.36 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6851  hypothetical protein  24.06 
 
 
306 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258194  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0391  hypothetical protein  22.43 
 
 
299 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106466  normal  0.105659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  35.34 
 
 
178 aa  55.5  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5796  hypothetical protein  23.29 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  27.03 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4073  hypothetical protein  27.17 
 
 
463 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.446677  decreased coverage  0.00970707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  28.44 
 
 
198 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  28.44 
 
 
198 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  28.44 
 
 
198 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  28.44 
 
 
198 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  28.44 
 
 
198 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  24.4 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  29.36 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  25 
 
 
160 aa  45.1  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  25.81 
 
 
489 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  25.69 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  25.69 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  25.69 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  23.14 
 
 
196 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  32.46 
 
 
170 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>