13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3390 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3975  hypothetical protein  60.84 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2119  hypothetical protein  48.52 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2367  hypothetical protein  49.68 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6851  hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258194  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0548  dialkylrecorsinol condensing enzyme DarA  38.95 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.339602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1103  hypothetical protein  34.86 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  37.27 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5796  hypothetical protein  34.88 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0391  hypothetical protein  33.21 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106466  normal  0.105659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  27.1 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  22.79 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4073  hypothetical protein  26.37 
 
 		 463 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.446677  decreased coverage  0.00970707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>