14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0548 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0548  dialkylrecorsinol condensing enzyme DarA  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.339602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1103  hypothetical protein  47.97 
 
 		 300 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0391  hypothetical protein  45.76 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106466  normal  0.105659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5796  hypothetical protein  42.35 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6851  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.258194  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2119  hypothetical protein  37.16 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2367  hypothetical protein  36.42 
 
 		 316 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3975  hypothetical protein  37.82 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3390  hypothetical protein  39.84 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  35.61 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  29.67 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  28.37 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4073  hypothetical protein  20.93 
 
 		 463 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.446677  decreased coverage  0.00970707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>