77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5572 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  64.5 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  51.55 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  45.98 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  45.75 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  38.75 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  43.97 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  43.26 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  40.27 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  39.55 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  28.21 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  28.03 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  33.63 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.8 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  27.78 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  32.64 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  27.95 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  36.15 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  31.3 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  31.15 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  29.03 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  29.1 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  30 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.27 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.09 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  29.46 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  26.23 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  23.02 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  35.96 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  33.7 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  27.78 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  29.06 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  22.83 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  26.45 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  31.36 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 297 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  29.69 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  26.12 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  27.5 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  30.63 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.01 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  29.91 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  29.06 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  27.2 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  29.91 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  29.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  28.47 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  26.83 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  27.69 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.69 
 
 		 265 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 428 aa  45.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.43 
 
 		 256 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 281 aa  44.3  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  25.35 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  30.59 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  22.97 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.97 
 
 		 272 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  31.07 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  32.46 
 
 		 224 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  24 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  29.63 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.23 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.07 
 
 		 276 aa  40.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  29.29 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>