122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0279 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  55.77 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  53.59 
 
 		 172 aa  180  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  49.34 
 
 		 178 aa  176  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  43.95 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  46.15 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  44.03 
 
 		 196 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  45.34 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  40.76 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  39.78 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  50.39 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  41.46 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  39.04 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  36.84 
 
 		 180 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  44.88 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  38.82 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  38.41 
 
 		 489 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  35.06 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  35.88 
 
 		 221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  34.39 
 
 		 197 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  31.17 
 
 		 224 aa  114  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  33.33 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  33.33 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  37.09 
 
 		 225 aa  104  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  34.56 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  33.95 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  34.18 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  34.42 
 
 		 205 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  32.12 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  30.82 
 
 		 205 aa  90.5  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.66 
 
 		 428 aa  80.9  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  29.17 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  29.93 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  28.21 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  30.47 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  29.69 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.71 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  30.66 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  29.61 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  28.12 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  31.21 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  33.07 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25.32 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 297 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  31.25 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  28.83 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  23.02 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  26.85 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  35 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  27.2 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  33.59 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.95 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  31.25 
 
 		 199 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  21.43 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  26.72 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.19 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  27.01 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  26.36 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  32.09 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  32.09 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  32.09 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.03 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  26.61 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  24.81 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  26.67 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  24.81 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  28 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  25.96 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  26.92 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  28.26 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  30 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  29 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  26.04 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.84 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  30 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  28.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  25 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  25.71 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  26.56 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  26.36 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  30.39 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.82 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  24.03 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  30.48 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  27.62 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  28.36 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  28.36 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  28.36 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>