52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0712 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 297 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  39.62 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  29.93 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.23 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  29.63 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  32.76 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  30.63 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  28.46 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  28.95 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  28.97 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  29.79 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.08 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  31.86 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  29.53 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  29.23 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  30.34 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  27.78 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  28.39 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  28.39 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  29.6 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  24.06 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  31.9 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  25.45 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  27.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  22.76 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  25.69 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.04 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  30.91 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 		 489 aa  48.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  27.52 
 
 		 197 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  30.77 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  29.06 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  29.47 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  23.74 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  26.43 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  30.47 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  30.93 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  26.23 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  26.27 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  23.81 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.45 
 
 		 428 aa  40.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>