62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3241 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  61.96 
 
 		 197 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  59.56 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  63.09 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  43.12 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  41.18 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  47.02 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  41.61 
 
 		 230 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  41.72 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  38.41 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  37.75 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  33.97 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  38.93 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  35.15 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  42.95 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  33.33 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  32.51 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  33.93 
 
 		 225 aa  104  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  37.32 
 
 		 228 aa  104  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  39.1 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  33.13 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  31.05 
 
 		 221 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  31.05 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  35.57 
 
 		 155 aa  99  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  33.97 
 
 		 159 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  36.36 
 
 		 157 aa  95.1  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  30.54 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  34.23 
 
 		 153 aa  91.3  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  31.9 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  31.93 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  35.61 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.97 
 
 		 428 aa  75.1  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  24.74 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.32 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  31.53 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  33.04 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  31.15 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  24.12 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  26.32 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  25.17 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  27.87 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  24.18 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  27.66 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  30.84 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  26.9 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  28.41 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  26.45 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  24.83 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  25.84 
 
 		 190 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  26.97 
 
 		 189 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  24.14 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  24.43 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>