42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2113 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  69.66 
 
 
205 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  41.04 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  39.88 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  38.37 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  38.07 
 
 
205 aa  125  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  34.59 
 
 
230 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  34.32 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  34.25 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  30.18 
 
 
197 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  28.07 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  31.14 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  29.12 
 
 
228 aa  95.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  27.81 
 
 
221 aa  94.4  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  30.41 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  30.59 
 
 
221 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 
189 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  27.88 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.97 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  35.86 
 
 
159 aa  85.1  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  32.09 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  26.44 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  27.22 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  29.17 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  30.2 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  26.16 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  25.57 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.81 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  27.27 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  29.68 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  25.29 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  30.28 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  23.53 
 
 
489 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  28.28 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  27.27 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.46 
 
 
164 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.11 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  24.84 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  26.9 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  30.77 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>