62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0445 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  41.46 
 
 
160 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  37.35 
 
 
230 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  42.42 
 
 
160 aa  134  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  37.95 
 
 
196 aa  130  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  41.78 
 
 
155 aa  124  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  37.13 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  38.75 
 
 
159 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  38.04 
 
 
172 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  37.27 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  41.22 
 
 
186 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  35.15 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  34.3 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  32.42 
 
 
180 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  37.35 
 
 
489 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  33.7 
 
 
228 aa  104  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  27.61 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  32.02 
 
 
221 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  30.11 
 
 
205 aa  94.4  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  32.24 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  26.79 
 
 
197 aa  91.3  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 
188 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  29.73 
 
 
221 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  29.73 
 
 
221 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  30 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  25.28 
 
 
205 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  27.81 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  23.64 
 
 
224 aa  79  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.18 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  26.99 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  28.68 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
428 aa  71.2  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  31.3 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  28.4 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  27.95 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  26.54 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  28.05 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.11 
 
 
193 aa  61.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  32.79 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  35.96 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25.15 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  24.37 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  26.96 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  27.03 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  28.07 
 
 
175 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.41 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  27.5 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.27 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  23.14 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  25.62 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.68 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  26.47 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  23.53 
 
 
177 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  22.79 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  25.24 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.53 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  23.08 
 
 
200 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>