More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3607 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  74.19 
 
 		 157 aa  254  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.55 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.59 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.51 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  33.97 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  35.54 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.58 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  35.21 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  32.42 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 		 209 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  35.92 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  34.51 
 
 		 197 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  35.46 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.12 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  32.12 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  33.8 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  31.39 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.39 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.51 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.57 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  31.39 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.06 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  31.09 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  31.09 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  31.09 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  31.09 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  31.39 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.39 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  32.12 
 
 		 687 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  34.51 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.12 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.39 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  34.31 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  29.58 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  34.51 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  32.84 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  31.69 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  32.39 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  33.1 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  33.8 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  33.58 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  32.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  32.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  32.39 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  31.3 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.69 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  32.39 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  29.08 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  32.39 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.06 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  31.69 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  30.52 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.15 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  29.58 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  32.39 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  29.38 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  34.31 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  33.33 
 
 		 202 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  31.94 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  30.07 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  28.87 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  29.58 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  32.61 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  29.84 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  27.46 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.88 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  28.17 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  30.66 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  36.19 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  30.56 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.07 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.86 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  30.07 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  27.97 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  30.07 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  28.17 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.54 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>