More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0330 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.77 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  43.21 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.57 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  36.18 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.2 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  34.91 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  39.76 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.02 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  32.5 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  36 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  33.85 
 
 		 207 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  34 
 
 		 199 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  34 
 
 		 199 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.94 
 
 		 200 aa  98.2  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.42 
 
 		 220 aa  97.8  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  31.84 
 
 		 201 aa  97.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  33.17 
 
 		 200 aa  97.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  31.34 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  32.34 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  31.19 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.83 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  33 
 
 		 199 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  31.84 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.65 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  31.35 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  31.34 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  31.35 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.69 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  30.69 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  31.84 
 
 		 200 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  30.69 
 
 		 200 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1270  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  35.12 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  32.84 
 
 		 199 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  33.33 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  32.18 
 
 		 200 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  34.67 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  31.16 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  33.85 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  34.34 
 
 		 199 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.27 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  32.34 
 
 		 199 aa  91.3  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  34.97 
 
 		 199 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  31.82 
 
 		 199 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  30.54 
 
 		 204 aa  91.3  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  33.67 
 
 		 199 aa  91.3  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  32.99 
 
 		 198 aa  90.9  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  29.06 
 
 		 204 aa  90.5  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  37.33 
 
 		 203 aa  90.5  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  31.5 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  31.47 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.14 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  35.76 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  31.5 
 
 		 199 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  30.24 
 
 		 208 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  30.65 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  33.67 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  28.64 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  28.64 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  29.21 
 
 		 200 aa  87.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  29.65 
 
 		 218 aa  87.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  33.7 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.16 
 
 		 209 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  36.18 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  30.96 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  30.96 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  29.9 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  31.34 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  35.97 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  33.67 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  28.78 
 
 		 212 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  27.14 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  35.25 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  30.15 
 
 		 198 aa  84.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  31.98 
 
 		 199 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  30.46 
 
 		 197 aa  84  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  33.68 
 
 		 198 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  29.8 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  29.8 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  29.8 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  31.44 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  28.5 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  31.96 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  31.96 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  32.64 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>