262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0643 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  100 
 
 		 172 aa  346  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  89.29 
 
 		 172 aa  307  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1270  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  75 
 
 		 174 aa  254  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  41.45 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  36.04 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.66 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  35.98 
 
 		 203 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  34.18 
 
 		 204 aa  97.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  33.5 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  33.5 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  41.04 
 
 		 203 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.97 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  35.86 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  33 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  34.87 
 
 		 207 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  32.98 
 
 		 197 aa  91.3  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  31.47 
 
 		 199 aa  90.9  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  31.96 
 
 		 200 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  31.94 
 
 		 218 aa  90.9  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  31 
 
 		 206 aa  90.9  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  31.96 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  32.47 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  31.44 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.18 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  35.86 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  41.82 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  34.54 
 
 		 200 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  41.13 
 
 		 199 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  32.47 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  34.87 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  31.96 
 
 		 200 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  31.44 
 
 		 200 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  32.46 
 
 		 199 aa  87.8  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  32.46 
 
 		 199 aa  87.8  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  34.05 
 
 		 190 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  34.87 
 
 		 199 aa  87.8  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  31.79 
 
 		 201 aa  87.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.48 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  34.01 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  34.67 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  39.85 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  34.02 
 
 		 206 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  34.17 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  32.43 
 
 		 200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  33.84 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  32.97 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  39.13 
 
 		 208 aa  84.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.14 
 
 		 203 aa  84.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  36.31 
 
 		 204 aa  84.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  34.01 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  34.9 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  34.05 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.61 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  31.94 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  31.82 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  40.15 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  32.8 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  33.16 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  33.33 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  33.33 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  33.33 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  33.33 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  38.69 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  35.18 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  34 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.41 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  32.83 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  43.55 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  32.99 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  39.55 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  33.33 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.52 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  33.52 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  33 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  33.33 
 
 		 687 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  34.5 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  29.84 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.02 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  30.94 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  33.52 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  37.59 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  32.24 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  32.4 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2568  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.95 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  37.24 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  37.23 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  31.63 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  31.17 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  34.53 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.06 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>