231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0482 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
176 aa  369  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.75 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.72 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.59 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  30.5 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  29.8 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.4 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.81 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  30.67 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.87 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  30.87 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  30.87 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.18 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  31.54 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  30.87 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.1 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.93 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  29.44 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  29.17 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  28.72 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  26.83 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  29.69 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  29.53 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  29.11 
 
 
203 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.69 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.55 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  29.22 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.72 
 
 
220 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  30.43 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  28.93 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.15 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.93 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.11 
 
 
209 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.69 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  25.17 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  29.53 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  27.89 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  26.73 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.02 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  27.89 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.78 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  27.16 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  27.56 
 
 
204 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  27.32 
 
 
197 aa  58.2  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.55 
 
 
200 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  33.33 
 
 
218 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  28.86 
 
 
206 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  27.32 
 
 
205 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  26.67 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  26.46 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  27.18 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  29.93 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  30.67 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  30.67 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  29.2 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  29.66 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  26.67 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  26.67 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  25.4 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  26.67 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  27.23 
 
 
687 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  28.99 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  30.73 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  28.67 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.41 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.05 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  28.3 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  27.94 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  26.8 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  28.3 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  29.38 
 
 
198 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  26.27 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  31.54 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  26.8 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  27 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  25.77 
 
 
197 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  25.81 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.47 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  25.39 
 
 
200 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  28.12 
 
 
197 aa  54.7  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  28.12 
 
 
197 aa  54.7  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  27.94 
 
 
202 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  27.56 
 
 
199 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  27.89 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  27.27 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  26.53 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  28.48 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.86 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  28.35 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  23.08 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  31.48 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2568  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.67 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>