226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2071 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  100 
 
 
156 aa  323  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  41.89 
 
 
423 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  36.67 
 
 
878 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
400 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  36 
 
 
878 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
425 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 
396 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  34.51 
 
 
404 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.11 
 
 
397 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.18 
 
 
585 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
396 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.76 
 
 
601 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
597 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
395 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  36.18 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.12 
 
 
569 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  36.18 
 
 
399 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
421 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
573 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  31.76 
 
 
409 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.41 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  31.76 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.32 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.99 
 
 
396 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 
571 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
576 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 
571 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  32.7 
 
 
575 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
402 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  33.33 
 
 
584 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 
570 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  31.03 
 
 
418 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
405 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
402 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  33.56 
 
 
407 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  30.19 
 
 
574 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
407 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.01 
 
 
573 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.61 
 
 
573 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  28.77 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.68 
 
 
401 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
407 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  31.51 
 
 
588 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.29 
 
 
397 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
405 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  29.38 
 
 
615 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.76 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.08 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.57 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  31.88 
 
 
600 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  30.32 
 
 
600 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
402 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  29.75 
 
 
500 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.37 
 
 
500 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  29.75 
 
 
616 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  30.14 
 
 
598 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  29.66 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.33 
 
 
498 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.13 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  31.16 
 
 
593 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  29.66 
 
 
613 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  28.48 
 
 
600 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  37.82 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
395 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.39 
 
 
397 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
395 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.77 
 
 
493 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.56 
 
 
504 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  39 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.85 
 
 
503 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.29 
 
 
485 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  28.76 
 
 
393 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
407 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  30.37 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  30.37 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.68 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  28.57 
 
 
597 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  30.15 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.21 
 
 
505 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
391 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  30.15 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.08 
 
 
499 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.1 
 
 
494 aa  61.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
398 aa  60.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
392 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.83 
 
 
479 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.93 
 
 
479 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.93 
 
 
479 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.93 
 
 
479 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.93 
 
 
479 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>