15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1509 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  70.59 
 
 		 176 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  70.59 
 
 		 176 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  65.69 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  59.57 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  46.94 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  33.7 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  35.42 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  30.68 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  33.7 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  27.84 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  29.35 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  30.34 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  35.48 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>