174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  64.78 
 
 
160 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  65 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  64.15 
 
 
160 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  61.25 
 
 
160 aa  213  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0832  flavodoxin FldA  62.5 
 
 
160 aa  208  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274141  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  59.75 
 
 
160 aa  191  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  50 
 
 
168 aa  150  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  46.58 
 
 
169 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  43.83 
 
 
170 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  42.6 
 
 
180 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  47.5 
 
 
168 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  43.2 
 
 
180 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  43.56 
 
 
165 aa  133  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  42.59 
 
 
175 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  42.59 
 
 
175 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  42.59 
 
 
175 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  44.85 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  43.98 
 
 
178 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  41.72 
 
 
194 aa  131  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  41.61 
 
 
170 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  43.79 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  42.86 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  43.21 
 
 
175 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  42.86 
 
 
175 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  42.24 
 
 
175 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  42.24 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  44.03 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
215 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
215 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
215 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  46.3 
 
 
163 aa  127  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  42.68 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  42.68 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  42.42 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  42.68 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  40.72 
 
 
179 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  42.68 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  40 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  42.24 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  41.98 
 
 
175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  40.83 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  40.85 
 
 
177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  41.36 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  42.94 
 
 
174 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  44.51 
 
 
174 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  40.72 
 
 
176 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  42.24 
 
 
174 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  44.81 
 
 
162 aa  123  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  39.39 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  39.39 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  38.89 
 
 
175 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  36.31 
 
 
164 aa  121  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  40 
 
 
175 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  37.65 
 
 
169 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  44.17 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  44.79 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  43.75 
 
 
163 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  38.46 
 
 
178 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  37.42 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4431  flavodoxin  43.64 
 
 
175 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  41.46 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  37.58 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  39.51 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0376  flavodoxin FldA  41.25 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000140694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  40.12 
 
 
171 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  36.97 
 
 
175 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  36.97 
 
 
175 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  36.97 
 
 
175 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  36.97 
 
 
175 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  39.13 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  36.36 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23658  flavodoxin  43.9 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2559  flavodoxin  41.21 
 
 
182 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  38.18 
 
 
178 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  38.75 
 
 
168 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  40.62 
 
 
163 aa  110  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  44.62 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  38.1 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  36.97 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1876  DedA family protein  37.97 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  44.19 
 
 
168 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  38.55 
 
 
173 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  38.55 
 
 
173 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  38.55 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  39.39 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  38.55 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  38.55 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>