99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0336 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  99.56 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  81.9 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  60 
 
 		 232 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  58.37 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  52.56 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  50.25 
 
 		 203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  47.83 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  44.02 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  40.65 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  39.53 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  41.82 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  41.78 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  39.8 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  38.3 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  38.22 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  38.3 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  39.29 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  40.37 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  37.63 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  40.12 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  42.86 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  38.07 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  33.7 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  38.96 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  39.61 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  38.6 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  38.31 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  34.38 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  38.01 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  37.66 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  33.82 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  36.05 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  38.31 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  40.19 
 
 		 427 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  33.33 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  36.96 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  26.76 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  28.75 
 
 		 715 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.34 
 
 		 1018 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  31.88 
 
 		 714 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  29.49 
 
 		 734 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.43 
 
 		 1018 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.32 
 
 		 721 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  23.78 
 
 		 656 aa  55.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.71 
 
 		 1018 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 		 1038 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  35.71 
 
 		 725 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.34 
 
 		 1040 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  28.47 
 
 		 722 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  26.02 
 
 		 727 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  30.28 
 
 		 721 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  29.01 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 1038 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  26.32 
 
 		 1042 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  23.45 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.41 
 
 		 722 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  25.49 
 
 		 906 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  26.72 
 
 		 716 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  25.49 
 
 		 906 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  31.45 
 
 		 1675 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.75 
 
 		 748 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  27.97 
 
 		 727 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.03 
 
 		 732 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  23.13 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.07 
 
 		 1019 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.89 
 
 		 738 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  26.24 
 
 		 1717 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.49 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  27.21 
 
 		 725 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  23.6 
 
 		 715 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  26.81 
 
 		 716 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.46 
 
 		 727 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  28.3 
 
 		 1011 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  33.72 
 
 		 738 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  23.81 
 
 		 731 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  25.74 
 
 		 695 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  28.15 
 
 		 731 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  30.25 
 
 		 728 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.66 
 
 		 908 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  25.36 
 
 		 715 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  27.34 
 
 		 730 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  24.81 
 
 		 736 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.08 
 
 		 727 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.03 
 
 		 738 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  26.25 
 
 		 521 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.81 
 
 		 719 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  27.27 
 
 		 726 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.72 
 
 		 734 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.72 
 
 		 734 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  23.19 
 
 		 737 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  29.46 
 
 		 724 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  29.67 
 
 		 908 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  29.46 
 
 		 724 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  30.25 
 
 		 767 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.57 
 
 		 743 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl264  putative multidrug ABC transporter  25.42 
 
 		 608 aa  42  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.04334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.35 
 
 		 696 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>