85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3210 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  69.85 
 
 		 223 aa  299  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  47.98 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  51.24 
 
 		 203 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  42.67 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  41.59 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  43.54 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  41.12 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  41.12 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  41.71 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  41.87 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  40.1 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  40.93 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  39.8 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  35.12 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  35.1 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  37.31 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  34.8 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  41.5 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  37.13 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  37.13 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  30.57 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  30.57 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  36.99 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  36.99 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  38 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  34.09 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  36.3 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  31.64 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  31.28 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  31.28 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  31.14 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  32.74 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  31.55 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  32.17 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  30.4 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  24.42 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  28.87 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  27.34 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.62 
 
 		 1011 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  25.32 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  28.67 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.03 
 
 		 725 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 		 906 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 		 906 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  27.67 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.82 
 
 		 908 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 728 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  27.34 
 
 		 736 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  24.38 
 
 		 722 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  26.06 
 
 		 716 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.37 
 
 		 738 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.82 
 
 		 1018 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  24.36 
 
 		 738 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.82 
 
 		 1018 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf637  bacteriocin exporter and processing endoprotease C39  28.87 
 
 		 675 aa  49.3  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.66238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  24.83 
 
 		 722 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  27.14 
 
 		 748 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  24.11 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  27.54 
 
 		 1040 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  24.5 
 
 		 1675 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  22.86 
 
 		 715 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  26.53 
 
 		 722 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  26.61 
 
 		 741 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  26.81 
 
 		 716 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 		 1038 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  25.78 
 
 		 730 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  33.33 
 
 		 734 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  25.58 
 
 		 735 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  23.02 
 
 		 737 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.11 
 
 		 1013 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  24.81 
 
 		 715 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.71 
 
 		 727 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.52 
 
 		 1019 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  25.76 
 
 		 1038 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  24.11 
 
 		 656 aa  43.1  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  25.52 
 
 		 726 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  25.85 
 
 		 1042 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  23.66 
 
 		 707 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  25.2 
 
 		 723 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  33.33 
 
 		 738 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  25.2 
 
 		 723 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  24.24 
 
 		 715 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  25.2 
 
 		 723 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  27.97 
 
 		 725 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>