77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3038 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 209 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  36.43 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  26.9 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  36.43 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  35.29 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  35.29 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  25.61 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  32.45 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  31.76 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  31.08 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  29.3 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  31.08 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  35.56 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  29.73 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.29 
 
 		 1018 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  32.35 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  35.43 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  27.27 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  30.41 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  26.7 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  25.97 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  30.28 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  27.74 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  32.82 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  25 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  30.95 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  28.85 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  24.28 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  29.73 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  31.54 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  28.89 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.73 
 
 		 1018 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  27.94 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  31.54 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.29 
 
 		 1040 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  31.01 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  28.15 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  29.06 
 
 		 730 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.06 
 
 		 759 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.05 
 
 		 1018 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.66 
 
 		 727 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  26.35 
 
 		 721 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  30.88 
 
 		 714 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  27.69 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  30.86 
 
 		 695 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.95 
 
 		 732 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  26.14 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.86 
 
 		 721 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  26.35 
 
 		 715 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  29.22 
 
 		 715 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  28.74 
 
 		 734 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  27.66 
 
 		 748 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  27.5 
 
 		 726 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.12 
 
 		 738 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  26.49 
 
 		 908 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  28.1 
 
 		 726 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  26.14 
 
 		 731 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  28.78 
 
 		 743 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  25.62 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.33 
 
 		 722 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.34 
 
 		 721 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  30.29 
 
 		 704 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  27.27 
 
 		 727 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  28.31 
 
 		 1675 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  27.91 
 
 		 427 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.61 
 
 		 734 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.61 
 
 		 734 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  28.26 
 
 		 724 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  25 
 
 		 716 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  26.32 
 
 		 728 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  28.26 
 
 		 724 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  26.35 
 
 		 722 aa  42.7  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.28 
 
 		 727 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.29 
 
 		 712 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  29.45 
 
 		 696 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.33 
 
 		 725 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  27.07 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>