134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1155 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 203 aa  420  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  65.84 
 
 		 237 aa  281  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  50.78 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  52.79 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  50.25 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  50.25 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  52.63 
 
 		 209 aa  197  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  52.41 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  49.23 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  47.42 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  44 
 
 		 261 aa  177  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  47.12 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  44.16 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  44.56 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  42.21 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  43.75 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  39.68 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  41.29 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  41.29 
 
 		 238 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  37.24 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  40.99 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  38.62 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  40.51 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  41.61 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  39.39 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  39.24 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  38.32 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  38.61 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  41.06 
 
 		 251 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  41.14 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  35 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  38.61 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  37.97 
 
 		 253 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  38 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  36.62 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  39.13 
 
 		 427 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  25.61 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  30.59 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  32.17 
 
 		 1675 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  27.91 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 		 906 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 		 906 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  29.45 
 
 		 722 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  28.1 
 
 		 734 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.54 
 
 		 908 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  28.32 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  27.27 
 
 		 715 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.85 
 
 		 738 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.3 
 
 		 908 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.03 
 
 		 721 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  27.59 
 
 		 1040 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  27.67 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  29.1 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.32 
 
 		 1011 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  31.94 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.2 
 
 		 1018 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  26.47 
 
 		 715 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.78 
 
 		 1018 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 1038 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.08 
 
 		 727 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  29.55 
 
 		 732 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  28.03 
 
 		 731 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.23 
 
 		 1018 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1038 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  28.68 
 
 		 743 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  36.14 
 
 		 738 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.88 
 
 		 738 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  27.27 
 
 		 730 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.95 
 
 		 1013 aa  52.4  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 728 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  26.58 
 
 		 721 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  26.15 
 
 		 1717 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  25.85 
 
 		 1042 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  24.08 
 
 		 727 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.03 
 
 		 725 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  23.65 
 
 		 726 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  25.93 
 
 		 719 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.07 
 
 		 1019 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  30.25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  24.09 
 
 		 715 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  26.87 
 
 		 736 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  25.41 
 
 		 721 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  24.75 
 
 		 724 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  25.32 
 
 		 727 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  25.4 
 
 		 741 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  25.52 
 
 		 656 aa  47.8  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  26.76 
 
 		 696 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  24.75 
 
 		 724 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  24.43 
 
 		 725 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  25.76 
 
 		 726 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  27.48 
 
 		 772 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  27.69 
 
 		 707 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.72 
 
 		 770 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 		 753 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 		 753 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 		 707 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  25.66 
 
 		 731 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 		 707 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 		 707 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 		 707 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>