86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2422 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 251 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  42.25 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  42.78 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  41.45 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  41.75 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  41.06 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  34.38 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  34.38 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  41.5 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  41.5 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  42.21 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  34.94 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  35.19 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  35.63 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  38.41 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  39.63 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  32.28 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  32.52 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  35.95 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  33.94 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  36.6 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  33.55 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  35.76 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  35.76 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  34.62 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  35.76 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  33.97 
 
 		 226 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  29.24 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  34.69 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  32.03 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  30.11 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  33.77 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  34.33 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  30.61 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  36.13 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  29.1 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  28.74 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 728 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  27.94 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  26.09 
 
 		 715 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  29.91 
 
 		 727 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  26.12 
 
 		 725 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  28.21 
 
 		 725 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  24.8 
 
 		 741 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  27.27 
 
 		 715 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  28.06 
 
 		 715 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  25 
 
 		 723 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  25.32 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  25 
 
 		 723 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  23.29 
 
 		 1018 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.6 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.37 
 
 		 743 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  24.22 
 
 		 723 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  24.43 
 
 		 714 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.12 
 
 		 727 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.7 
 
 		 1018 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  24.29 
 
 		 731 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  22.38 
 
 		 736 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  22.9 
 
 		 712 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  26.57 
 
 		 732 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.34 
 
 		 727 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  25.66 
 
 		 706 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  25.66 
 
 		 706 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  29.33 
 
 		 683 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  25.66 
 
 		 706 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  23.84 
 
 		 714 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0582  hypothetical protein  26.17 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  26.36 
 
 		 730 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  27.52 
 
 		 721 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  23.89 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  24.14 
 
 		 734 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  25.66 
 
 		 706 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 707 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  25.17 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.2 
 
 		 908 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  25.62 
 
 		 721 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  26.05 
 
 		 721 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  25.81 
 
 		 1717 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  29.51 
 
 		 724 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  29.51 
 
 		 724 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>