69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1020 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  50.48 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  49.23 
 
 		 203 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  45.33 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  47.64 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  41.7 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  45.18 
 
 		 261 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  44.02 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  44.02 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  48.39 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  41.04 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  47.5 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  42.54 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  42.99 
 
 		 225 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  40.53 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  40.35 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  45.03 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  39.34 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  38.8 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  38.8 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  35.81 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  43.05 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  33.62 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  35.68 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  42.38 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  36.6 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  44.22 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  40.76 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  40.76 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  43.24 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  36.27 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  39.05 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  35.75 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  34.94 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  36.17 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  36.07 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  31.85 
 
 		 715 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  27.86 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  28.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  30.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  25.15 
 
 		 714 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  28.17 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.37 
 
 		 715 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.22 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  28.76 
 
 		 716 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.22 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  26.11 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  30.58 
 
 		 728 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  22.06 
 
 		 656 aa  48.9  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  29.6 
 
 		 1675 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  26.47 
 
 		 715 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.47 
 
 		 732 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.15 
 
 		 1018 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  29.69 
 
 		 731 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  23.2 
 
 		 906 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30 
 
 		 734 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  23.2 
 
 		 906 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  29.46 
 
 		 725 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.66 
 
 		 721 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  28.57 
 
 		 722 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  28.35 
 
 		 727 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  26.12 
 
 		 1717 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  26.95 
 
 		 722 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.34 
 
 		 721 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.5 
 
 		 736 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  25 
 
 		 727 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  27.78 
 
 		 725 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  27.13 
 
 		 726 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  29.85 
 
 		 714 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>