111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  98.42 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  79.45 
 
 		 253 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  50.83 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  41.75 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  43.05 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  39.77 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  38.67 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  41.08 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  38.01 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  38.01 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  39.76 
 
 		 232 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  36.53 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  36.48 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  36.05 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  37.97 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  39.86 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  43.92 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  32.62 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  36.05 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  36.05 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  39.74 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  37.66 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  32.56 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  37.04 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  34.42 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  33.77 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  33.54 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  32.91 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  33.54 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  33.54 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  32.91 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  33.17 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  34.75 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  30.72 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  32.88 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  33.33 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  29.08 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1038 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.37 
 
 		 714 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  30.28 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.5 
 
 		 1018 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  29.1 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  28.02 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.78 
 
 		 1018 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  28.46 
 
 		 737 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  31.01 
 
 		 725 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.09 
 
 		 908 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.06 
 
 		 1018 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28 
 
 		 1042 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 906 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  31.79 
 
 		 732 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  30.3 
 
 		 715 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.28 
 
 		 725 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  31.54 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 906 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.09 
 
 		 1013 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.62 
 
 		 724 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.38 
 
 		 722 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  27.15 
 
 		 715 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  29.45 
 
 		 731 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  34.19 
 
 		 727 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.73 
 
 		 908 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.12 
 
 		 1019 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 726 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.99 
 
 		 715 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.39 
 
 		 1040 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26.71 
 
 		 738 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  31.62 
 
 		 748 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 743 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.56 
 
 		 1011 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.53 
 
 		 736 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  23.53 
 
 		 741 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  30.23 
 
 		 723 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  30.65 
 
 		 723 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  30.23 
 
 		 723 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  33.91 
 
 		 696 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.2 
 
 		 734 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  32.48 
 
 		 1675 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  33.02 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.03 
 
 		 727 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.41 
 
 		 721 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.46 
 
 		 738 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  27.13 
 
 		 738 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  27.46 
 
 		 721 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.08 
 
 		 707 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.75 
 
 		 721 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  22.22 
 
 		 656 aa  44.7  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  30.19 
 
 		 706 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  30.19 
 
 		 706 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.27 
 
 		 1717 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  30.19 
 
 		 706 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  25 
 
 		 716 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.83 
 
 		 726 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>