129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1024 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  100 
 
 
237 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  95.36 
 
 
237 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  73.36 
 
 
236 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  50 
 
 
238 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  50 
 
 
238 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  84.03 
 
 
427 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  42.27 
 
 
226 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  37.61 
 
 
226 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  39.11 
 
 
226 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  37.61 
 
 
226 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  36.7 
 
 
226 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  41.38 
 
 
234 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  36.4 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  37.95 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  38.46 
 
 
235 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  39.06 
 
 
235 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  37.74 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  38.62 
 
 
203 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  40.12 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  40.12 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  39.51 
 
 
234 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  34.92 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  35.75 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  34.03 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  39.73 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  32.52 
 
 
251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  32.16 
 
 
231 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  35.67 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  35.98 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  37.58 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  35.06 
 
 
253 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  34.25 
 
 
223 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  35.17 
 
 
225 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  34.42 
 
 
253 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  32.57 
 
 
266 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  35.86 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.76 
 
 
1038 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.76 
 
 
1038 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  31.39 
 
 
715 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  32.21 
 
 
727 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  26.51 
 
 
736 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.84 
 
 
1018 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  30.89 
 
 
1717 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  25.65 
 
 
197 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  33.6 
 
 
748 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  26.71 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  27.27 
 
 
209 aa  62  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.66 
 
 
1018 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  25.95 
 
 
726 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  31.54 
 
 
734 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.6 
 
 
1040 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.97 
 
 
1018 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.93 
 
 
714 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  29.03 
 
 
719 aa  58.9  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  26.19 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.88 
 
 
759 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30 
 
 
721 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
743 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  31.88 
 
 
731 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.94 
 
 
1019 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  28.08 
 
 
722 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 
906 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 
906 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  27.92 
 
 
725 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.08 
 
 
727 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  26.28 
 
 
716 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.78 
 
 
741 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  28.46 
 
 
1675 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  32.14 
 
 
728 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.78 
 
 
732 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  28.57 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.57 
 
 
908 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  26.03 
 
 
715 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.91 
 
 
721 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  26.25 
 
 
716 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  28.26 
 
 
724 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  28.26 
 
 
724 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  27.97 
 
 
731 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  28.15 
 
 
908 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  29.29 
 
 
521 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  25.81 
 
 
725 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  25.71 
 
 
715 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.33 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  29.27 
 
 
696 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  25.49 
 
 
738 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.33 
 
 
734 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  28.38 
 
 
714 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.15 
 
 
721 aa  48.5  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  27.1 
 
 
1011 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.99 
 
 
727 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  26.81 
 
 
695 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  29.58 
 
 
707 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  26.56 
 
 
730 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>