114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2967 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  69.19 
 
 		 235 aa  315  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  47.35 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  47.79 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  46.46 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  46.46 
 
 		 226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  50 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  44.69 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  42.13 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  39.57 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  40.51 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  39.57 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  38.46 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  37.95 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  37.89 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  39.77 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  37.99 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  36.41 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  39.01 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  35.81 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  38.32 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  38.36 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  36.42 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  35.75 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  33.7 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  33.7 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  36.36 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  37.87 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  37.65 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  32.56 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  35.03 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  36.26 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  34.62 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  35.85 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  41.38 
 
 		 427 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  34.18 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  30.99 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 1038 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  28.22 
 
 		 1038 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  30 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 743 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  28.97 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  28.67 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  25.97 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  33.99 
 
 		 732 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  31.03 
 
 		 722 aa  58.9  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.49 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.71 
 
 		 1018 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  29.03 
 
 		 721 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  27.27 
 
 		 714 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  28.85 
 
 		 714 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.28 
 
 		 759 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  27.97 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.33 
 
 		 722 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  26.82 
 
 		 1675 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  29.38 
 
 		 748 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.01 
 
 		 1018 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.43 
 
 		 1018 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.68 
 
 		 1019 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.62 
 
 		 1040 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.64 
 
 		 736 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  28.35 
 
 		 908 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.46 
 
 		 727 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  24.31 
 
 		 1011 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  25.15 
 
 		 734 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  26.56 
 
 		 906 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  26.56 
 
 		 906 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.69 
 
 		 1717 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  28 
 
 		 723 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.98 
 
 		 908 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  28 
 
 		 723 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.17 
 
 		 727 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  25.5 
 
 		 716 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  27.21 
 
 		 715 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  27.97 
 
 		 723 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  23.78 
 
 		 760 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  27.59 
 
 		 696 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.23 
 
 		 719 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  27.27 
 
 		 725 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  24.66 
 
 		 725 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  26.87 
 
 		 715 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  23.49 
 
 		 724 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.78 
 
 		 721 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  25.5 
 
 		 734 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  25.5 
 
 		 734 aa  46.2  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  28.47 
 
 		 767 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  27.78 
 
 		 721 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  23.61 
 
 		 695 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.21 
 
 		 739 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  24.24 
 
 		 727 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  24.62 
 
 		 695 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26.24 
 
 		 738 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  27.01 
 
 		 724 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  27.01 
 
 		 724 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  27.7 
 
 		 731 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  23.62 
 
 		 741 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  23.74 
 
 		 720 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.58 
 
 		 1013 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  24.29 
 
 		 716 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.14 
 
 		 727 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>