109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3887 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  35 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  33.14 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  36.88 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  32.3 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  34.75 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  36.31 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  33.33 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  33.33 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  33.33 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  36.55 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  34.04 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  38.28 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  33.57 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  35.42 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  37.86 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  36.11 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  34.33 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  32.87 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  34.42 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  36.17 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  35.17 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  32.86 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  31.67 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  32.17 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  33.79 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  34.48 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  33.79 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  31.29 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  33.79 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  33.14 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  32.85 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  32.37 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  30.43 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  30.43 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  29.37 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  30.22 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.58 
 
 		 1018 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  30.71 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  36.36 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.71 
 
 		 1040 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.71 
 
 		 1018 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 1038 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.13 
 
 		 1018 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 1038 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  30.46 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  31.03 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.57 
 
 		 1019 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  33.04 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  27.13 
 
 		 725 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  27.34 
 
 		 726 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  31.82 
 
 		 721 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  32.41 
 
 		 727 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  28.67 
 
 		 1717 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.48 
 
 		 759 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  29.46 
 
 		 737 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  27.68 
 
 		 728 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.2 
 
 		 908 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  28.69 
 
 		 714 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  27.42 
 
 		 736 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 707 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  30.09 
 
 		 707 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  27.05 
 
 		 716 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  25.81 
 
 		 1011 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  25.23 
 
 		 908 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  21.32 
 
 		 741 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  24.79 
 
 		 721 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0582  hypothetical protein  25.35 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.97 
 
 		 748 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  26.47 
 
 		 722 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.93 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30 
 
 		 725 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.7 
 
 		 727 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  26.15 
 
 		 1675 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.63 
 
 		 727 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  25.95 
 
 		 735 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  22.76 
 
 		 737 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  26.05 
 
 		 1042 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  23.42 
 
 		 730 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  27.78 
 
 		 734 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.23 
 
 		 739 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  24.79 
 
 		 726 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  25.35 
 
 		 726 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  28.33 
 
 		 707 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  28.57 
 
 		 707 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  31.68 
 
 		 721 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  25.93 
 
 		 767 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  26.67 
 
 		 715 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  24.22 
 
 		 727 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25 
 
 		 738 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  28.32 
 
 		 738 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  23.97 
 
 		 725 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  31.82 
 
 		 731 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  30.33 
 
 		 706 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>