77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2316 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  64.29 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  47.42 
 
 		 203 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  40.26 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  45.31 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  40.55 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  48.77 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  39.19 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  39.19 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  46.5 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  42 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  38.5 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  40.84 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  41.07 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  38.25 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  37.64 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  40.14 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  31.35 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  31.35 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  35.53 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  38 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  34.1 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  35.19 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  32.62 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  37.41 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  33.88 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  34.43 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  34.19 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  34.25 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  37.67 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  34.25 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  32.35 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  29.37 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  33.33 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  24.85 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  27.34 
 
 		 736 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  25.95 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  24.63 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  24.09 
 
 		 715 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.92 
 
 		 722 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  27.56 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  24.32 
 
 		 1011 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  26.76 
 
 		 716 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  28.47 
 
 		 722 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.14 
 
 		 1018 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.14 
 
 		 1018 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 728 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.2 
 
 		 1018 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26.24 
 
 		 738 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  28.68 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  23.4 
 
 		 656 aa  48.5  0.00007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.34 
 
 		 727 aa  48.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.52 
 
 		 908 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  25.19 
 
 		 906 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  25.19 
 
 		 906 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  26.98 
 
 		 725 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  25 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  27.46 
 
 		 748 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf637  bacteriocin exporter and processing endoprotease C39  26.76 
 
 		 675 aa  45.8  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.66238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  24.84 
 
 		 760 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  25 
 
 		 1040 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25 
 
 		 722 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  26.4 
 
 		 699 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  28.57 
 
 		 705 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.09 
 
 		 739 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  25 
 
 		 908 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  24.66 
 
 		 721 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  25.81 
 
 		 715 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  27.43 
 
 		 719 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  27.27 
 
 		 1675 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  26.72 
 
 		 731 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  26.11 
 
 		 716 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  25.6 
 
 		 1038 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  26.96 
 
 		 706 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.88 
 
 		 759 aa  41.6  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>